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八八水災造成南部多處工業區停擺，石化業損失慘重，但台南縣超過150公頃的工業區滯洪池發揮功能，即使面臨雨量空前、南科園區北邊曾文溪潰堤、曾文水庫洩洪等不利因素考驗，園區內廠商都未受到影響。

台南縣政府指出，台南縣開發的工業區包括柳營工業區、樹谷園區，都設置大面積滯洪池，不僅發揮排水防洪功能，更具景觀效果，還可協助鄰近鄉鎮減少水患。

在這次八八水災中，印證了滯洪池的效果，未來台南縣開發的工業區，包括永康科技工業區、七股科技工業區等，都將全面設置滯洪池，並計劃以科學園區防洪規格來吸納區外廠商進駐工業區。

縣政府統計，在此次災情中，員工人數十人以上的廠家計2,469家，約占縣內合法工廠家數40%。因為受損失的廠商都不在工業區或科學園區，未來縣政府將全力推動廠商進駐工業區。

南科管理局長陳俊偉表示，南科開發初期遭遇過多次嚴重水患，但自民國87年區內的30公頃工業用地移作滯洪池（迎曦湖）使用，以及投入10餘億元整治大洲排水、鹽水溪流域後，南科就不再淹水，鄰近區域以往遇水必淹的困境也獲得改善。

南科園區的滯洪池中，聯電旁邊的道爺湖、台積電前面的霞客湖，主要做為蓄湖功能。奇美電旁邊的迎曦湖，面積廣達20公頃，就以吸納區外雨量為主。

縣政府指出，這次急水溪暴漲、下游淹了一樓半高，酪農業重創，但柳營科工區因滯洪池發揮功能，並未淹水。樹谷園區因曾文水庫洩洪、曾文溪潰堤，水位激增，也因曼陀鈴湖滯洪，吸納大量洪水，使樹谷園區並遭淹水之患，包括啟耀光電、奇景、奇美材料等廠商都受到保護。

縣府表示，這次水災證實滯洪池在平常具有多重功能，水災發生時，還可協助區外的排水滯洪，未來台南縣開發的各工業區，都將設置滯洪池。